SNP en los alineamientos

Un SNP en un alineamiento es una posición en la que las letras de la columna no se corresponden.

Las mismas dos secuencias de la diapositiva anterior, A C A G A C guion G A y A C A T A C A G A, colocadas una sobre la otra. Tienen nucleótidos idénticos en siete de las nueve posiciones, indicados con asteriscos. En la cuarta posición, donde la secuencia superior tiene una G mientras que la secuencia inferior tiene una T, la etiqueta sobre este desajuste indica que se trata de un SNP.
Un ejemplo de Polimorfismo de un Solo Nucleótido (SNP, por sus siglas en inglés).